Trước đó, sáng 7/9, anh P.Q.T (sinh năm 1982, trú tại huyện Quốc Oai, Hà Nội, lái xe taxi) điều khiển xe ô tô đi chở khách. Sau đó, gia đình không liên lạc được với anh T. Do ảnh hưởng cơn bão số 3, đến sáng 8/9, gia đình mới tìm kiếm và phát hiện xe ô tô của anh T tại xã Sen Phương, huyện Phúc Thọ. Ngay sau đó, Công an huyện Phúc Thọ đã cùng gia đình tìm kiếm khu vực xung quanh và phát hiện thi thể anh T tại mép bờ sông Đáy (thôn Bảo Lộc 5, xã Võng Xuyên, huyện Phúc Thọ); nghi vấn anh T bị sát hại.

Giám đốc Giám đốc Công an thành phố đã chỉ đạo Công an huyện Phúc Thọ phối hợp các đơn vị nghiệp vụ khẩn trương điều tra, truy bắt đối tượng gây án để xử lý nghiêm theo quy định. Mặc dù điều kiện thời tiết hết sức bất lợi, mưa to gió lớn do ảnh hưởng của bão số 3, đối tượng gây án liên tục di chuyển qua nhiều tỉnh, thành nhưng các lực lượng đã khắc phục khó khăn, nỗ lực điều tra, truy bắt. Đến khoảng 5 giờ 30 phút ngày 10/9, các bên liên quan đã phát hiện, bắt giữ đối tượng Nguyễn Duy Phương. Làm việc với Công an, Phương đã thừa nhận hành vi phạm tội.

Theo điều tra, sáng 7/9, Phương đi bộ đến ngã ba thị trấn Quốc Oai thì gặp xe taxi của anh P.Q.T. Phương thuê anh T chở đến xã Phú Cường, huyện Ba Vì để gặp người thân. Khi gần đến gần cầu Văn Lang (Ba Vì), Phương ngồi sau lấy sợi dây dù vòng qua cổ anh T xiết mạnh. Thấy anh T tử vong, Phương điều khiển xe ô tô của anh T đi lòng vòng, tìm địa điểm vắng để giấu, phi tang xác nạn nhân. 

Khoảng 14 giờ cùng ngày, đối tượng đến khu vực Dự án sinh thái Cẩm Đình - Hiệp Thuận ở xã Võng Xuyên, huyện Phúc Thọ thì xe bị sa lầy, ắc quy hết điện. Phương xuống xe nhờ người dân địa phương tìm hộ xe cứu hộ. Trong lúc chờ xe, đối tượng lục lọi và lấy được khoảng 3 triệu đồng; kéo thi thể nạn nhân xuống mép nước bờ sông Đáy, lấy cành lá khô che đậy nhằm tránh bị phát hiện.

Sau đó, Phương nhờ được người kéo xe ô tô ra khỏi bãi lầy, tiếp tục đi lòng vòng để tìm chỗ giấu xe nhưng khi đến đường liên xã Phụng Thượng - Long Xuyên thì xe bị sạt bánh xuống mép ruộng. Do đang mưa bão lớn, không tìm được xe cứu hộ, đối tượng khóa xe lại rồi đi tìm nhà nghỉ gần đó để ngủ. 

Khoảng 10 giờ ngày 8/9, Phương thuê người kéo xe ô tô lên rồi lái xe đến thôn 14 xã Sen Phương; bỏ lại xe ô tô và đi về nhà. Sau đó, Phương mua xăng, định quay lại đốt xe ô tô phi tang. Khi gần đến nơi đỗ xe, thấy nhiều người dân và Công an đứng xung quanh xe ô tô nên đã bỏ đi, bắt xe khách đi Cao Bằng. Khi đến Cao Bằng, Phương lại bắt xe đi ngược về Hà Nội rồi quay trở lại huyện Thạch Thất. Rạng sáng 9/9, Phương bị bắt giữ.

Hiện Công an huyện Phúc Thọ đang phối hợp các đơn vị nghiệp vụ củng cố hồ sơ, xử lý nghiêm đối tượng theo quy định pháp luật.